Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup54Q8BTS4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms