Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf18Q8BM39 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Prpf18Q8BM39 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Prpf18Q8BM39 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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