Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6bQ8BKI2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms