Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp1Q8BJQ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms