Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcal1Q8BJL0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms