Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms