Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbfox3Q8BIF2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms