Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdca8Q8BHX3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdca8Q8BHX3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms