Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms