Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms