Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Katnb1Q8BG40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms