Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2bQ8BG39 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms