Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc50Q810U5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms