Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfascQ810U3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms