Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms