Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b3Q80ZS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms