Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms