Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClspnQ80YR7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClspnQ80YR7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms