Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp8Q80YR6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms