Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WhrnQ80VW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WhrnQ80VW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms