Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms