Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms