Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Mycbp2Q7TPH6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms