Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CdsnQ7TPC1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdsnQ7TPC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms