Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf2Q7TMI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uhrf2Q7TMI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms