Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms