Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Trappc6aQ78XR0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6aQ78XR0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms