Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd3eapQ76KJ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms