Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms