Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms