Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms