Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf653Q6YND2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf653Q6YND2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms