Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssx9Q6XAS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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