Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms