Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms