Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc154Q6RUT8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms