Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn2Q6PHP6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms