Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc57Q6PHN1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms