Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms