Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms