Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rad54bQ6PFE3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms