Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd4Q6PDQ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms