Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms