Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms