Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gapvd1Q6PAR5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gapvd1Q6PAR5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms