Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx6Q6P8X1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms