Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms