Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Soga3Q6NZL0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms