Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh1Q6IUP1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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