Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm4Q6IRU2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tpm4Q6IRU2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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